外泌體(Exosomes)是一類直徑約30-150 nm的細(xì)胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs),可由多種類型細(xì)胞在正常及病理狀態(tài)下分泌,廣泛參與細(xì)胞間通訊,并在腫瘤微環(huán)境調(diào)控、免疫調(diào)節(jié)、神經(jīng)退行性疾病等多個研究領(lǐng)域展現(xiàn)出重要價值[1]。隨著外泌體研究的深入,如何高效可靠地分離外泌體成為科研人員關(guān)注的焦點(diǎn)。不同的分離方法在純度、回收率、操作便捷性等方面各有千秋,研究者需根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求選擇最合適的分離方法。
本期細(xì)胞學(xué)堂將全面介紹外泌體分離的五個主要方法,并深入探討如何選擇合適的方法分離外泌體,助您順利展開實(shí)驗(yàn)。
如何選擇合適的外泌體分離方法
外泌體分離主要方法詳解
超速離心法
(Ultracentrifugation, UC)
原理
超速離心法是根據(jù)樣品中外泌體與其他成分在尺寸和密度上的差異,通過一系列不同離心力和離心時間的超速離心步驟,逐步去除非外泌體成分,最終將外泌體沉淀并重新懸浮。
圖1 超速離心流程示意圖[2]
優(yōu)點(diǎn)
1
去除了大部分污染物,分離得到的外泌體較純凈
2
適用于大體積樣本(如細(xì)胞培養(yǎng)上清、血清等)
3
無需額外試劑,避免了化學(xué)試劑的污染
缺點(diǎn)
1
需要超速離心機(jī),設(shè)備昂貴,操作復(fù)雜
2
高離心力可能導(dǎo)致外泌體結(jié)構(gòu)損傷,影響其完整性
3
回收率較低,部分外泌體可能無法有效沉淀
密度梯度離心法
(Density Gradient Centrifugation, DGC)
原理
密度梯度離心法是一種基于外泌體與其他細(xì)胞成分密度差異的精細(xì)分離技術(shù)。通常使用蔗糖或碘克沙醇(Iodixanol)作為密度梯度介質(zhì),并通過超速離心來實(shí)現(xiàn)。外泌體會根據(jù)自身浮力密度(1.13–1.19 g/mL)在特定界面富集。
分離步驟
1
樣品預(yù)處理:離心去除細(xì)胞碎片和大顆粒雜質(zhì);
2
密度梯度制備:通過逐漸混合不同密度的蔗糖或碘克沙醇溶液,形成一個從低密度到高密度的連續(xù)密度梯度;
3
樣品加載與超速離心:將外泌體粗提物(PBS重懸后)緩慢鋪于密度梯度頂部,以100,000–120,000 ×g,16-18 h,4℃進(jìn)行超速離心;
4
外泌體收集:使用移液器或取樣管在1.13-1.19 g/mL密度范圍內(nèi)回收富集的外泌體層;
5
介質(zhì)去除與重懸:將收集到的外泌體用PBS稀釋后再次進(jìn)行100,000 ×g,70 min離心,去除梯度介質(zhì)并重懸外泌體。
優(yōu)點(diǎn)
1
外泌體純度高,可去除蛋白、脂質(zhì)等污染物
2
適用于對外泌體功能研究要求較高的實(shí)驗(yàn)
缺點(diǎn)
1
操作繁瑣,需要長時間(≥16 h)離心
2
樣本處理量小,不適合大規(guī)模樣本分離
尺寸排阻色譜法
(Size-Exclusion Chromatography, SEC)
原理
利用多孔球狀填料形成色譜柱,樣本流經(jīng)色譜柱時,不同尺寸的分子以不同速率流出。外泌體(30-150 nm)介于大蛋白與細(xì)胞外囊泡之間,可在特定洗脫體積內(nèi)被收集。
分離步驟
1
樣品預(yù)處理:去除大顆粒雜質(zhì),并適當(dāng)濃縮樣品以提高分離效率;
2
色譜柱準(zhǔn)備:裝填適合外泌體分離的填料,使用緩沖液平衡柱體;
3
樣品上樣:緩慢加載樣品,避免擾動填料結(jié)構(gòu);
4
洗脫與收集:按分級洗脫原則,優(yōu)先收集外泌體富集部分;
5
濃縮與純化(可選):使用超濾或二次離心等方法提高外泌體純度。
優(yōu)點(diǎn)
1
溫和無損傷,外泌體結(jié)構(gòu)保持完整
2
操作簡便,無需超速離心設(shè)備
3
分離效果較好,可去除蛋白污染
缺點(diǎn)
1
純度受限,仍可能殘留其他細(xì)胞外囊泡
2
不適用于超大體積樣本
聚合物沉淀法
(Polymer Precipitation)
原理
利用聚合物(如聚乙二醇,PEG)降低外泌體表面水合層的溶解度,使其在低速離心條件下沉淀,從而從生物樣本中分離外泌體
分離步驟
1
樣品預(yù)處理:去除大顆粒雜質(zhì),提高外泌體回收率;
2
添加聚合物溶液:充分混勻,低溫孵育使外泌體沉淀;
3
離心收集:低速離心獲取沉淀,去除上清;
4
重懸與純化(可選):使用緩沖液重懸,可結(jié)合其他純化方法,如超濾、密度梯度離心等以提高純度。
優(yōu)點(diǎn)
1
操作簡單,時間短(< 4 h)
2
無需昂貴設(shè)備,適用于實(shí)驗(yàn)室常規(guī)分離
3
適合大體積樣本(血清、尿液等)
缺點(diǎn)
1
可能存在聚合物殘留污染,影響下游實(shí)驗(yàn)(如蛋白分析)
2
共沉淀大量蛋白和其他顆粒,外泌體純度較低
免疫親和分離法
(Immunoaffinity-Based Isolation)
原理
利用磁珠或親和樹脂為固相載體,表面固定CD9、CD63、CD81等外泌體特異性抗體,特異性結(jié)合并分離外泌體。
分離步驟
1
樣品預(yù)處理:去除大顆粒雜質(zhì),提高分離效率;
2
抗體結(jié)合:靶向外泌體表面標(biāo)志物的抗體與固相載體偶聯(lián);
3
外泌體捕獲:將樣品與偶聯(lián)抗體孵育,使外泌體特異性結(jié)合;
4
洗滌與洗脫:去除非特異性結(jié)合物,釋放外泌體。
優(yōu)點(diǎn)
1
純度極-高,可用于特定類型外泌體富集
2
適用于高靈敏度分析(如qPCR、Western blot等)
缺點(diǎn)
1
試劑昂貴,適合小規(guī)模研究
2
易丟失部分外泌體,回收率低
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參考文獻(xiàn)
[1]
Théry C, Zitvogel L, Amigorena S. Exosomes: composition, biogenesis and function [J]. Nature Reviews Immunology, 2002 Aug; 2(8):569-579.
[2]
Théry C, Amigorena S, Raposo G, et al. Isolation andcharacterization of exosomes from cell culture supernatants and biological fluids [J]. Current Protocols in Cell Biolog, 2006 Apr; Chapter 3: Unit 3.22.
[3]
Contreras-Naranjo JC, Wu HJ, Ugaz VM. Microfluidics for exosome isolation and analysis: enabling liquid biopsy for personalized medicine [J]. Lab on a Chip, 2017 Oct 25; 17(21):3558-3577.